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哺乳动物基因组

图片由布罗德研究所提供

迄今为止,研究人员的一个宇宙大利民队已发布最大的哺乳动物基因组。被称为项目图片,数据库中包含所有哺乳动物家庭的80%的基因组,随着推进人类健康研究的意图。

瑞典乌普萨拉大学教授、布罗德研究所脊椎动物基因组学科学主任Kerstin lindbladto说:“这个项目的核心思想是开发和利用这些数据来帮助人类遗传学家找出导致疾病的突变。新闻稿

欢迎来到基因组方舟

为此,当然,研究人员需要哺乳动物基因组 - 以及尽可能多的。

基因组只是一种有机体的全遗传蓝图;一切都在那里,到底板。完整的基因组可以帮助研究人员更紧密地了解他们所属的动物(如,就像2020年的子图)一样巨型亚洲谋杀大黄蜂)。

Zoonomia项目是对2006年启动的“29哺乳动物项目”(29哺乳动物项目)的扩展。据布罗德研究所称,《动物分类》的哺乳动物基因组宝库涵盖了240个物种,代表了82%的哺乳动物科。

这些动物拥有人类不具备的独特能力;布罗德的名字检查了两个可爱的例子,冬眠的松鼠和奇怪长寿的蝙蝠。他们还关注获取濒危物种的基因组。

总的来说,动物分类项目中超过一半的哺乳动物基因组以前从未被分析和编目过。

为了收集这些可爱的基因信息,研究人员与全球28个机构合作,狮子的份额来自圣地亚哥动物园的冷冻动物园,这是世界上最大的冷冻动物园。

该工具那些哺乳动物基因组出生,发表于自然,将开放以供研究人员使用。

研究人员写道:“通过对系统发育多样性进行优先排序,并快速、不受限制地提供数据,Zoonomia项目旨在支持生物发现、医学研究和生物多样性保护。”

动物基因和人类病毒

在丹麦水貂成为SARS-COV-2传输的传染媒介 - 从人们跳到水貂和再次回来 - 研究人员和公共卫生官员必须考虑病毒可以藏在动物,变异和溢出中,这可能拼写麻烦。

找出动物易受冠状病毒的首选武器攻击的东西穗蛋白,可以帮助我们避免这些动物传染病的伏击。刺突蛋白的首选目标是一种叫做ACE2的细胞受体。ACE2存在于各种组织中,包括呼吸道(很明显),但不仅存在于人类。

布罗德研究所的研究人员,以及加州大学戴维斯分校和其他机构,试图通过观察动物的ACE2受体与我们的受体匹配程度来识别潜在的危险动物。我们的ACE2受体中有25种氨基酸;一种动物与我们共享的25种基因越多,它们可能就越脆弱。

在Zoonomia项目中的一半哺乳动物基因组从未分析过并编目。

加州大学戴维斯分校博士后Joana Damas说:“所有25个氨基酸残基与人类蛋白匹配的动物通过ACE2感染SARS-CoV-2的风险最高。。“据预测,这种物种的ACE2结合残留物(那些氨基酸)与人类的差异越大,风险就会降低。”

虽然他们搜索了亨托和yon - 包括爬行动物,两栖动物,鸟类和鱼 - 它是哺乳动物基因组,许多来自Zoonomia,其中包含最清醒的新闻。目前被螺纹悬挂的动物似乎是高风险,包括三大猿 - 北白颊长臂猿(可爱的作为地狱),西部低地大猩猩(令人生畏的以及苏门答腊猩猩(高飞如地狱)。

数据库也已经产生了另一种洞察力。哺乳动物容易消失的遗传多样性低于其他遗传多样性;这表明从只有一个物种采样和分析基因组可能有助于告诉我们大多数人受到风险的影响,也许有助于我们更好的目标保护努力。

(在这方面,也不全是厄运和忧郁;遗传学也帮助我们找到了被认为已经灭绝的物种,包括新几内亚歌唱狗,这是,我向您保证,而不是弥补。)

虽然这些早期成果很有希望,但真正的价值可能还没有到来;在一个地方有如此多的哺乳动物基因组可供整个科学界使用,这可能会产生新的见解。

“一旦您将数据广泛使用并向更广泛的研究社区解释它,您可以真正改变科学方式,”广阔的脊椎动物基因组学群体主任Elinor Karlsson表示。

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