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移动世界。
“人体的谷歌地图”在我们的一万亿个细胞内部提供了深刻的观点

引导图像©Eduard Muzhevskyi / Adob​​e Stock

人体由万亿细胞组成,这些细胞控制着我们所看到的一切看法我们喜欢的披萨浇口。但是,尽管这些细胞对我们的生活产生了巨大影响,但精确解释了如何他们的影响是一个极其棘手的科学问题 - 以及识别和预防疾病的极端科学重要性。

研究人员的国际财团希望他们的项目,是人体生物分子阿特拉斯计划(HubMap),可以通过帮助科学家更好地可视化这个内部,蜂窝世界来开始解决这个问题。

项目是第一组开源数据其中包含来自七种类型的器官的300多个样本,细节向各个细胞发布给公众和科学界,可以成为帮助科学家创造一个人体互动的互动的互动度的框架。

为什么我们需要地图

如果一个大型科学项目探索人体听起来熟悉,这是因为科学家在2000年代初期在映射人类基因组时完成了类似的任务。这个基因组项目教授科学家人类的基本DNA化妆,但它仍然没有解决对我们的机构如何工作的所有问题。

如果基因是您的身体用于运行的指令书,单元格是执行这些指示的信使。这些行动如何看待和互动在现实生活中是这个新项目希望回答的问题。

细胞如何在现实生活中互动是这个新项目希望回答的问题。

该项目的目标是美国和欧洲的18个研究机构之间的合作,是使用健康的组织样本来构建科学家的互动平台,以探索人体在细胞水平上的不同部分,如解剖学版本的Google地图。

类似于Google地图如何帮助您在自己的社区中浏览一个未知的城市,甚至识别隐藏的街道,HubMap旨在帮助科学家探讨人体中细胞之间的不同功能和连接。

通过仅使用“健康”组织来创建该地图(意思,无病理组织),Hubmap可以用作最终的备注纸,以比较患病的组织样本。例如,可视化健康乳房组织中细胞之间的关系可以帮助科学家更好地了解乳腺癌引起的变化。

这种至关重要的基线比较可以帮助科学家更好地发展治疗疾病,Jonathan Silverstein.是匹兹堡大学研究财团和访问教授的研究成员,解释说明一份声明

“将正常细胞与不同疾病条件的比较将非常出色地发展治疗各种疾病的策略。”

数据

本月由团队发布的就职数据包含来自33个躯体,肾脏,大肠,小肠,淋巴结,脾和胸腺的组织样本。

用显微镜,质谱和全基因组和RNA测序分析样品。这些技术在一起帮助科学家看到构成这些组织的超小细胞以及它们的互动。

使用HubMap的在线门户网站,任何人都可以在捐赠者,组织样本和完整的数据集和交互式可视化之间在匿名信息之间切换。

虽然这些信息可能是令人困惑的一般公众,但项目团队表示,外科医生可以使用这种数据来解释疾病的进展和对患者的干预,通过计算生物学家更好地了解不同疾病的进展,甚至是药物开发商寻找毒品候选人的新治疗用途。

更多来

从30多个捐助者的组织样本并不是一个完全成熟的人类地图集,但研究人员表示,这种就职数据释放只是一个开始。

除了在未来更多机构中添加样品,还希望扩大捐赠者池的多样性,也可以包括来自更广泛的人体的样本。全部样本到目前为止来自美国的大学,所有目前的样本都来自白色(26)或黑人或非裔美国人捐助者。

由于这个项目继续扩大其产品,Silverstein表示他认为这将是很长一段时间的重要资源。

“我在职业生涯中做了很多大项目,但毫无疑问是最令人兴奋的一个,因为这是使用的方式的数量只是非凡,”Silverstein说。“这将是一个很大的国家资源很长一段时间。”

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