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冠状病毒突变

Lead Image©Полина Томтосова / Adobe Stock

来自Drexel大学的科学家拥有开发了一个工具可以快速识别和标记冠状病毒突变。

他们认为,他们的工具可能能够帮助官员追踪新型冠状病毒Sars-CoV-2的传播,并确定社交隔离措施正在发挥积极作用的地方。

它还可以帮助发展治疗疫苗对于冠状病毒 - 帮助将Covid-19尽快结束。

鉴定冠状病毒突变

与任何病毒一样,冠状病毒的遗传密码在人与人之间传播时偶尔会发生轻微的变化或突变。

我们可以了解这些冠状病毒突变,更好的指责我们将要打击病毒。但识别所有30,000个碱基对中的突变基因组可能是耗时的。

在一个发布于预印刷服务器上bioRxiv4月16日,Drexel团队详细介绍了他们创建的工具,可以加快过程。

病毒的遗传密码偶尔会经历略微的变化,因为它从人与人传播。

该论文称,在分析了3832个冠状病毒基因组样本后,他们确定了序列上的17个位置,这些位置“对不同个体测序的病毒基因组之间的差异提供了高度信息”。

基本上,在这17个位置匹配的冠状病毒基因组样本,就其冠状病毒突变而言,都属于病毒的一个“亚型”。

该团队创建了一种工具,可以基于这些17个位置为任何Coronavirus序列生成子类型标签,并使研究人员提供通过GitHub

首席研究员盖尔·罗森在新闻发布会上说:“这相当于扫描条形码,而不是输入完整的产品代码。”“现在,我们都在努力更快地逛完杂货店。”

与COVID-19

罗森表示,跟踪冠状病毒的突变可以帮助我们了解病毒在地理上是如何传播的。例如,纽约流行的亚型与来自奥地利和法国的亚型相匹配,而不是来自意大利的亚型。

追踪也可以让我们更多地了解遏制努力的效果 - 例如,如果一个亚型没有分开某个区域,例如,我们可能知道人口的社会疏远努力正在工作。

在整个Covid-19爆发中持续跟踪冠状病毒突变也可以告知我们如何对待它 - 毕竟流感病毒突变以这样的方式,研究人员必须创造一个新的疫苗每年都要与之斗争。

然而,根据Drexel团队对冠状病毒突变的分析,看起来我们不得不用Covid-19疫苗担心。

Rosen说:“我们看到,病毒的两个似乎没有发生变异的部分正是负责进入健康细胞并包装RNA的部分。”

“这两者都是了解身体免疫应答,识别抗病毒治疗和设计疫苗的重要目标,”她继续。

不过,如果情况发生变化,我们开始看到冠状病毒以不同的方式变异,研究人员可能需要重点考虑他们如何计划治疗或预防感染——现在他们有了一种更快的识别冠状病毒突变的方法,这将不是一项令人生畏的任务。

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